Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMX2Q04743 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMX2Q04743 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMX2Q04743 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms