Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM3AP98173 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
FAM3AP98173 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FAM3AP98173 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms