Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSNK2BP67870 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK2BP67870 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSNK2BP67870 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms