Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVPABLB-1P60509 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVPABLB-1P60509 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ERVPABLB-1P60509 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVPABLB-1P60509 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms