Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P54278 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P54278 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P54278 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P54278 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P54278 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P54278 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P54278 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P54278 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PMS2P54278 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS2P54278 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS2P54278 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS2P54278 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PMS2P54278 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMS2P54278 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMS2P54278 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMS2P54278 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMS2P54278 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMS2P54278 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PMS2P54278 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMS2P54278 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMS2P54278 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMS2P54278 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMS2P54278 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PMS2P54278 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PMS2P54278 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS2P54278 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS2P54278 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS2P54278 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PMS2P54278 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PMS2P54278 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS2P54278 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS2P54278 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS2P54278 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS2P54278 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS2P54278 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS2P54278 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS2P54278 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS2P54278 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS2P54278 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS2P54278 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS2P54278 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS2P54278 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS2P54278 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PMS2P54278 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS2P54278 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS2P54278 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS2P54278 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS2P54278 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PMS2P54278 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMS2P54278 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMS2P54278 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PMS2P54278 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS2P54278 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS2P54278 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS2P54278 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PMS2P54278 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS2P54278 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS2P54278 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS2P54278 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS2P54278 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS2P54278 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PMS2P54278 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMS2P54278 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PMS2P54278 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMS2P54278 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PMS2P54278 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PMS2P54278 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS2P54278 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS2P54278 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS2P54278 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS2P54278 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS2P54278 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS2P54278 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PMS2P54278 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS2P54278 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS2P54278 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS2P54278 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PMS2P54278 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS2P54278 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS2P54278 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS2P54278 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS2P54278 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P54278 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P54278 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P54278 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P54278 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P54278 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P54278 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P54278 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PMS2P54278 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMS2P54278 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMS2P54278 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMS2P54278 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMS2P54278 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMS2P54278 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMS2P54278 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PMS2P54278 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS2P54278 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS2P54278 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms