Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 MRPS28YDR337W 861 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 YGR127WYGR127W 939 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 PRI1YIR008C 1230 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 OPI8YKR035C 642 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 IRC11YOR013W 471 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 DUG1YFR044C 1446 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 NOG2YNR053C 1461 nt6.72□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 ECM38YLR299W 1983 nt6.71□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 AVO1YOL078W 3531 nt6.71□□□□□ -1.33
YNL058CP53947 MAK32YCR019W 1092 nt6.71□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 TRS31YDR472W 852 nt6.71□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 CTF8YHR191C 402 nt6.71□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.71□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 YOR268CYOR268C 399 nt6.71□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 YEL020CYEL020C 1683 nt6.71□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 YJL163CYJL163C 1668 nt6.71□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 SKI2YLR398C 3864 nt6.71□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 TEL2YGR099W 2067 nt6.7□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 YKR032WYKR032W 315 nt6.7□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 KSH1YNL024C-A 219 nt6.7□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 EDE1YBL047C 4146 nt6.7□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 DEF1YKL054C 2217 nt6.69□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 TKL1YPR074C 2043 nt6.69□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 EFT2YDR385W 2529 nt6.69□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 EFT1YOR133W 2529 nt6.69□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 AGX1YFL030W 1158 nt6.69□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 YPT1YFL038C 621 nt6.69□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 RPR1RPR1 369 nt6.69□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 SEC62YPL094C 825 nt6.69□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 CCC2YDR270W 3015 nt6.69□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 MSC3YLR219W 2187 nt6.69□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 SLA2YNL243W 2907 nt6.69□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 DDC1YPL194W 1839 nt6.69□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 HSP12YFL014W 330 nt6.68□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 YNL092WYNL092W 1203 nt6.68□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 TOS6YNL300W 309 nt6.68□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 MFG1YDL233W 1377 nt6.68□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 ARP3YJR065C 1350 nt6.68□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 SEC18YBR080C 2277 nt6.67□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 SET5YHR207C 1581 nt6.67□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 FPR2YDR519W 408 nt6.67□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 HIS1YER055C 894 nt6.67□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 YGL072CYGL072C 360 nt6.67□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 SWD1YAR003W 1281 nt6.67□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 FIT2YOR382W 462 nt6.67□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 SSK1YLR006C 2139 nt6.67□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 AVT4YNL101W 2142 nt6.67□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 EIS1YMR031C 2532 nt6.66□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 YIL077CYIL077C 963 nt6.66□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 SML1YML058W 315 nt6.66□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 SUB2YDL084W 1341 nt6.66□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 VMS1YDR049W 1899 nt6.65□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 PPH21YDL134C 1110 nt6.65□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 RMA1YKL132C 1293 nt6.65□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 CCP1YKR066C 1086 nt6.65□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 SUR7YML052W 909 nt6.65□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 LGE1YPL055C 999 nt6.65□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 SPE3YPR069C 882 nt6.65□□□□□ -1.34
YNL058CP53947 NUP49YGL172W 1419 nt6.65□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 HEM1YDR232W 1647 nt6.65□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 FAT3YKL187C 2253 nt6.64□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 YOL046CYOL046C 675 nt6.64□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.64□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 IVY1YDR229W 1362 nt6.63□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 OGG1YML060W 1131 nt6.63□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 AIM33YML087C 939 nt6.63□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 COQ1YBR003W 1422 nt6.63□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 HST2YPL015C 1074 nt6.63□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 COX10YPL172C 1389 nt6.63□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 YPL277CYPL277C 1464 nt6.62□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 RFC4YOL094C 972 nt6.62□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 RPO26YPR187W 468 nt6.62□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 GEX1YCL073C 1848 nt6.62□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 STT3YGL022W 2157 nt6.61□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 YMR027WYMR027W 1413 nt6.61□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 EEB1YPL095C 1371 nt6.61□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 ZIM17YNL310C 525 nt6.61□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 SIT1YEL065W 1887 nt6.61□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 ELP3YPL086C 1674 nt6.61□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 SES1YDR023W 1389 nt6.6□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 DOT1YDR440W 1749 nt6.6□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.6□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 YJR146WYJR146W 354 nt6.6□□□□□ -1.35
YNL058CP53947 FBA1YKL060C 1080 nt6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.7 ms