Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMSP52788 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMSP52788 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMSP52788 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMSP52788 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMSP52788 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMSP52788 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMSP52788 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMSP52788 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMSP52788 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMSP52788 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMSP52788 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMSP52788 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMSP52788 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMSP52788 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMSP52788 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMSP52788 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMSP52788 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMSP52788 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMSP52788 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMSP52788 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMSP52788 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMSP52788 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMSP52788 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMSP52788 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMSP52788 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMSP52788 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMSP52788 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMSP52788 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMSP52788 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMSP52788 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SMSP52788 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMSP52788 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMSP52788 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMSP52788 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMSP52788 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMSP52788 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMSP52788 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMSP52788 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMSP52788 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMSP52788 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMSP52788 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMSP52788 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SMSP52788 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMSP52788 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMSP52788 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMSP52788 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMSP52788 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMSP52788 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMSP52788 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMSP52788 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMSP52788 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMSP52788 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMSP52788 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMSP52788 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMSP52788 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMSP52788 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMSP52788 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMSP52788 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMSP52788 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMSP52788 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMSP52788 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMSP52788 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SMSP52788 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMSP52788 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMSP52788 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMSP52788 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMSP52788 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMSP52788 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMSP52788 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMSP52788 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMSP52788 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMSP52788 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMSP52788 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMSP52788 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMSP52788 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMSP52788 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMSP52788 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMSP52788 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMSP52788 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMSP52788 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMSP52788 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMSP52788 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMSP52788 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMSP52788 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMSP52788 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMSP52788 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMSP52788 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMSP52788 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMSP52788 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMSP52788 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMSP52788 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMSP52788 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMSP52788 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMSP52788 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMSP52788 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMSP52788 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMSP52788 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMSP52788 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMSP52788 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms