Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF2A1P52655 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2A1P52655 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2A1P52655 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms