Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNJ1P48048 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ1P48048 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ1P48048 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms