Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL27AP46776 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL27AP46776 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPL27AP46776 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL27AP46776 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL27AP46776 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL27AP46776 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL27AP46776 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL27AP46776 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL27AP46776 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL27AP46776 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPL27AP46776 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPL27AP46776 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPL27AP46776 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPL27AP46776 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPL27AP46776 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPL27AP46776 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms