Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RANBP1P43487 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RANBP1P43487 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms