Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRIA3P42263 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIA3P42263 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIA3P42263 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRIA3P42263 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA3P42263 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms