Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDH1P40925 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MDH1P40925 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDH1P40925 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDH1P40925 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MDH1P40925 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDH1P40925 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDH1P40925 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDH1P40925 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDH1P40925 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDH1P40925 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MDH1P40925 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDH1P40925 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDH1P40925 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDH1P40925 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDH1P40925 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDH1P40925 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MDH1P40925 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDH1P40925 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDH1P40925 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDH1P40925 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDH1P40925 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDH1P40925 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDH1P40925 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDH1P40925 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MDH1P40925 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDH1P40925 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDH1P40925 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDH1P40925 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDH1P40925 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MDH1P40925 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MDH1P40925 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MDH1P40925 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MDH1P40925 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MDH1P40925 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDH1P40925 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDH1P40925 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDH1P40925 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MDH1P40925 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDH1P40925 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDH1P40925 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDH1P40925 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDH1P40925 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDH1P40925 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDH1P40925 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDH1P40925 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDH1P40925 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDH1P40925 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDH1P40925 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDH1P40925 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDH1P40925 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDH1P40925 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDH1P40925 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDH1P40925 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDH1P40925 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDH1P40925 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDH1P40925 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDH1P40925 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDH1P40925 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDH1P40925 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDH1P40925 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDH1P40925 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDH1P40925 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MDH1P40925 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDH1P40925 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDH1P40925 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDH1P40925 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDH1P40925 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDH1P40925 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDH1P40925 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDH1P40925 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDH1P40925 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDH1P40925 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDH1P40925 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDH1P40925 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDH1P40925 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDH1P40925 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDH1P40925 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDH1P40925 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MDH1P40925 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDH1P40925 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDH1P40925 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDH1P40925 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDH1P40925 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDH1P40925 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDH1P40925 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDH1P40925 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDH1P40925 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDH1P40925 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDH1P40925 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDH1P40925 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDH1P40925 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDH1P40925 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDH1P40925 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDH1P40925 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDH1P40925 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDH1P40925 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDH1P40925 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDH1P40925 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDH1P40925 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms