Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VHLP40337 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VHLP40337 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VHLP40337 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VHLP40337 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VHLP40337 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VHLP40337 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VHLP40337 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VHLP40337 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VHLP40337 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VHLP40337 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VHLP40337 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VHLP40337 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VHLP40337 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VHLP40337 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VHLP40337 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VHLP40337 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VHLP40337 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VHLP40337 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VHLP40337 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VHLP40337 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VHLP40337 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VHLP40337 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VHLP40337 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VHLP40337 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VHLP40337 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VHLP40337 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VHLP40337 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VHLP40337 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VHLP40337 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VHLP40337 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VHLP40337 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VHLP40337 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VHLP40337 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VHLP40337 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VHLP40337 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VHLP40337 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VHLP40337 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VHLP40337 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VHLP40337 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VHLP40337 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VHLP40337 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VHLP40337 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VHLP40337 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VHLP40337 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VHLP40337 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VHLP40337 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VHLP40337 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VHLP40337 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VHLP40337 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VHLP40337 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VHLP40337 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VHLP40337 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VHLP40337 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VHLP40337 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VHLP40337 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VHLP40337 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VHLP40337 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VHLP40337 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VHLP40337 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VHLP40337 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VHLP40337 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VHLP40337 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VHLP40337 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VHLP40337 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VHLP40337 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VHLP40337 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VHLP40337 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VHLP40337 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VHLP40337 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VHLP40337 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VHLP40337 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VHLP40337 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VHLP40337 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VHLP40337 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VHLP40337 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VHLP40337 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VHLP40337 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VHLP40337 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VHLP40337 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VHLP40337 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VHLP40337 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VHLP40337 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VHLP40337 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VHLP40337 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VHLP40337 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VHLP40337 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VHLP40337 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VHLP40337 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VHLP40337 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VHLP40337 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VHLP40337 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VHLP40337 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VHLP40337 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VHLP40337 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VHLP40337 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VHLP40337 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VHLP40337 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VHLP40337 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VHLP40337 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms