Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEACAM6P40199 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CEACAM6P40199 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEACAM6P40199 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEACAM6P40199 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CEACAM6P40199 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CEACAM6P40199 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CEACAM6P40199 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEACAM6P40199 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEACAM6P40199 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CEACAM6P40199 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CEACAM6P40199 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms