Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP62P37198 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP62P37198 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP62P37198 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP62P37198 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP62P37198 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP62P37198 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP62P37198 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP62P37198 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NUP62P37198 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP62P37198 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP62P37198 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP62P37198 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NUP62P37198 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP62P37198 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP62P37198 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP62P37198 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP62P37198 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP62P37198 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP62P37198 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP62P37198 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP62P37198 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP62P37198 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NUP62P37198 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP62P37198 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP62P37198 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP62P37198 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP62P37198 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP62P37198 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP62P37198 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NUP62P37198 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP62P37198 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP62P37198 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP62P37198 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP62P37198 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP62P37198 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NUP62P37198 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NUP62P37198 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP62P37198 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP62P37198 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NUP62P37198 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP62P37198 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP62P37198 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP62P37198 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUP62P37198 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP62P37198 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP62P37198 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP62P37198 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP62P37198 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP62P37198 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP62P37198 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP62P37198 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP62P37198 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP62P37198 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUP62P37198 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP62P37198 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP62P37198 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP62P37198 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP62P37198 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP62P37198 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP62P37198 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP62P37198 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP62P37198 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP62P37198 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP62P37198 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUP62P37198 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP62P37198 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP62P37198 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP62P37198 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP62P37198 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP62P37198 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP62P37198 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUP62P37198 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP62P37198 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP62P37198 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP62P37198 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP62P37198 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP62P37198 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP62P37198 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUP62P37198 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP62P37198 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP62P37198 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP62P37198 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP62P37198 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP62P37198 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUP62P37198 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP62P37198 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP62P37198 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP62P37198 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP62P37198 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUP62P37198 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP62P37198 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP62P37198 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP62P37198 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP62P37198 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUP62P37198 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP62P37198 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP62P37198 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP62P37198 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUP62P37198 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms