Protein–RNA interactions for Protein: P34741

SDC2, Syndecan-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC2P34741 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDC2P34741 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDC2P34741 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDC2P34741 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDC2P34741 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDC2P34741 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDC2P34741 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDC2P34741 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDC2P34741 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDC2P34741 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDC2P34741 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDC2P34741 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDC2P34741 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDC2P34741 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDC2P34741 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDC2P34741 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDC2P34741 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDC2P34741 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDC2P34741 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDC2P34741 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDC2P34741 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDC2P34741 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDC2P34741 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SDC2P34741 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDC2P34741 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SDC2P34741 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SDC2P34741 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDC2P34741 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDC2P34741 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDC2P34741 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDC2P34741 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SDC2P34741 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDC2P34741 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDC2P34741 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDC2P34741 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDC2P34741 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDC2P34741 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDC2P34741 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDC2P34741 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SDC2P34741 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDC2P34741 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDC2P34741 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SDC2P34741 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDC2P34741 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDC2P34741 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDC2P34741 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDC2P34741 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDC2P34741 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SDC2P34741 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDC2P34741 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDC2P34741 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDC2P34741 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDC2P34741 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SDC2P34741 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDC2P34741 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDC2P34741 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDC2P34741 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDC2P34741 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDC2P34741 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDC2P34741 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDC2P34741 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDC2P34741 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDC2P34741 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDC2P34741 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDC2P34741 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDC2P34741 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDC2P34741 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDC2P34741 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDC2P34741 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDC2P34741 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDC2P34741 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDC2P34741 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDC2P34741 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDC2P34741 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDC2P34741 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDC2P34741 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDC2P34741 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDC2P34741 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDC2P34741 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDC2P34741 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDC2P34741 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDC2P34741 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDC2P34741 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDC2P34741 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDC2P34741 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDC2P34741 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDC2P34741 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDC2P34741 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDC2P34741 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDC2P34741 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDC2P34741 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDC2P34741 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDC2P34741 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDC2P34741 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDC2P34741 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDC2P34741 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDC2P34741 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDC2P34741 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDC2P34741 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDC2P34741 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms