Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSP1P33241 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSP1P33241 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSP1P33241 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSP1P33241 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSP1P33241 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LSP1P33241 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSP1P33241 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSP1P33241 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSP1P33241 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSP1P33241 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSP1P33241 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSP1P33241 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSP1P33241 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LSP1P33241 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LSP1P33241 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSP1P33241 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSP1P33241 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSP1P33241 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSP1P33241 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSP1P33241 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LSP1P33241 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LSP1P33241 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSP1P33241 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSP1P33241 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSP1P33241 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSP1P33241 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSP1P33241 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LSP1P33241 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSP1P33241 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LSP1P33241 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSP1P33241 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSP1P33241 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSP1P33241 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSP1P33241 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LSP1P33241 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSP1P33241 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSP1P33241 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSP1P33241 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSP1P33241 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LSP1P33241 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSP1P33241 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSP1P33241 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LSP1P33241 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSP1P33241 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSP1P33241 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSP1P33241 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LSP1P33241 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSP1P33241 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSP1P33241 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSP1P33241 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSP1P33241 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSP1P33241 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSP1P33241 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSP1P33241 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSP1P33241 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSP1P33241 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSP1P33241 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSP1P33241 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSP1P33241 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LSP1P33241 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LSP1P33241 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSP1P33241 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSP1P33241 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSP1P33241 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSP1P33241 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSP1P33241 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LSP1P33241 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSP1P33241 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSP1P33241 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSP1P33241 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSP1P33241 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSP1P33241 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSP1P33241 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSP1P33241 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSP1P33241 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSP1P33241 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSP1P33241 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSP1P33241 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSP1P33241 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSP1P33241 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSP1P33241 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSP1P33241 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSP1P33241 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSP1P33241 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSP1P33241 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSP1P33241 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSP1P33241 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSP1P33241 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSP1P33241 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSP1P33241 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSP1P33241 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSP1P33241 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSP1P33241 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSP1P33241 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSP1P33241 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSP1P33241 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSP1P33241 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSP1P33241 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSP1P33241 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms