Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CXCR5P32302 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CXCR5P32302 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CXCR5P32302 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms