Protein–RNA interactions for Protein: P30825

SLC7A1, High affinity cationic amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A1P30825 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC7A1P30825 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A1P30825 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC7A1P30825 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms