Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJB2P29033 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB2P29033 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB2P29033 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB2P29033 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB2P29033 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB2P29033 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB2P29033 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB2P29033 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB2P29033 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
GJB2P29033 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GJB2P29033 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJB2P29033 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GJB2P29033 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJB2P29033 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJB2P29033 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJB2P29033 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB2P29033 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB2P29033 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB2P29033 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB2P29033 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB2P29033 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB2P29033 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB2P29033 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB2P29033 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB2P29033 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB2P29033 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB2P29033 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB2P29033 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB2P29033 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB2P29033 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB2P29033 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB2P29033 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB2P29033 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB2P29033 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB2P29033 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJB2P29033 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJB2P29033 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJB2P29033 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJB2P29033 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJB2P29033 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJB2P29033 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJB2P29033 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB2P29033 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB2P29033 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB2P29033 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB2P29033 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB2P29033 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB2P29033 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB2P29033 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB2P29033 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB2P29033 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB2P29033 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB2P29033 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB2P29033 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB2P29033 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB2P29033 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB2P29033 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB2P29033 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB2P29033 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB2P29033 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJB2P29033 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJB2P29033 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJB2P29033 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJB2P29033 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJB2P29033 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJB2P29033 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJB2P29033 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJB2P29033 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB2P29033 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB2P29033 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB2P29033 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB2P29033 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB2P29033 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB2P29033 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB2P29033 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
GJB2P29033 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB2P29033 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB2P29033 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB2P29033 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB2P29033 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB2P29033 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB2P29033 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB2P29033 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB2P29033 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB2P29033 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJB2P29033 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJB2P29033 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJB2P29033 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJB2P29033 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB2P29033 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB2P29033 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB2P29033 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB2P29033 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB2P29033 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB2P29033 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB2P29033 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB2P29033 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB2P29033 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB2P29033 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms