Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX2P28328 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX2P28328 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX2P28328 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX2P28328 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX2P28328 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PEX2P28328 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX2P28328 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX2P28328 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX2P28328 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PEX2P28328 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX2P28328 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX2P28328 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX2P28328 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX2P28328 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX2P28328 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX2P28328 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX2P28328 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX2P28328 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX2P28328 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX2P28328 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX2P28328 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX2P28328 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX2P28328 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX2P28328 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX2P28328 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX2P28328 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX2P28328 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX2P28328 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX2P28328 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX2P28328 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX2P28328 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX2P28328 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX2P28328 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX2P28328 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX2P28328 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX2P28328 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX2P28328 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX2P28328 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX2P28328 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX2P28328 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX2P28328 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX2P28328 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX2P28328 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX2P28328 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX2P28328 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX2P28328 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX2P28328 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX2P28328 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX2P28328 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX2P28328 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX2P28328 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX2P28328 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX2P28328 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PEX2P28328 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX2P28328 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX2P28328 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX2P28328 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX2P28328 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX2P28328 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX2P28328 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX2P28328 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX2P28328 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX2P28328 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX2P28328 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX2P28328 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX2P28328 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX2P28328 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX2P28328 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX2P28328 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX2P28328 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX2P28328 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX2P28328 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX2P28328 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX2P28328 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX2P28328 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX2P28328 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX2P28328 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX2P28328 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX2P28328 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX2P28328 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX2P28328 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX2P28328 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX2P28328 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX2P28328 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX2P28328 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX2P28328 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX2P28328 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX2P28328 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX2P28328 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX2P28328 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX2P28328 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX2P28328 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX2P28328 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX2P28328 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX2P28328 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX2P28328 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX2P28328 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX2P28328 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX2P28328 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.8 ms