Protein–RNA interactions for Protein: P25364

HCM1, Forkhead transcription factor HCM1, yeastyeast

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCM1P25364 TAZ1YPR140W 1146 nt6.71□□□□□ -1.34
HCM1P25364 CAN1YEL063C 1773 nt6.71□□□□□ -1.34
HCM1P25364 ICL2YPR006C 1728 nt6.7□□□□□ -1.34
HCM1P25364 AGP2YBR132C 1791 nt6.7□□□□□ -1.34
HCM1P25364 ERP5YHR110W 639 nt6.7□□□□□ -1.34
HCM1P25364 YDL158CYDL158C 309 nt6.69□□□□□ -1.34
HCM1P25364 SUF3tG(CCC)D 72 nt6.69□□□□□ -1.34
HCM1P25364 MHT1YLL062C 975 nt6.69□□□□□ -1.34
HCM1P25364 NMD4YLR363C 657 nt6.69□□□□□ -1.34
HCM1P25364 MRPL24YMR193W 777 nt6.69□□□□□ -1.34
HCM1P25364 SRF1YDL133W 1314 nt6.69□□□□□ -1.34
HCM1P25364 TPI1YDR050C 747 nt6.68□□□□□ -1.34
HCM1P25364 YHR145CYHR145C 357 nt6.68□□□□□ -1.34
HCM1P25364 CUE4YML101C 354 nt6.68□□□□□ -1.34
HCM1P25364 LYS21YDL131W 1323 nt6.68□□□□□ -1.34
HCM1P25364 ERG24YNL280C 1317 nt6.68□□□□□ -1.34
HCM1P25364 NUP84YDL116W 2181 nt6.68□□□□□ -1.34
HCM1P25364 YGL102CYGL102C 429 nt6.67□□□□□ -1.34
HCM1P25364 SNF7YLR025W 723 nt6.67□□□□□ -1.34
HCM1P25364 SPC24YMR117C 642 nt6.67□□□□□ -1.34
HCM1P25364 ICP55YER078C 1536 nt6.66□□□□□ -1.34
HCM1P25364 SEC23YPR181C 2307 nt6.66□□□□□ -1.34
HCM1P25364 PUS7YOR243C 2031 nt6.66□□□□□ -1.34
HCM1P25364 DMC1YER179W 1005 nt6.66□□□□□ -1.34
HCM1P25364 SLX1YBR228W 915 nt6.66□□□□□ -1.34
HCM1P25364 ISR1YPR106W 1332 nt6.66□□□□□ -1.34
HCM1P25364 TOS2YGR221C 1869 nt6.65□□□□□ -1.34
HCM1P25364 SYF2YGR129W 648 nt6.65□□□□□ -1.34
HCM1P25364 EGD2YHR193C 525 nt6.65□□□□□ -1.34
HCM1P25364 MOG1YJR074W 657 nt6.65□□□□□ -1.34
HCM1P25364 YKL102CYKL102C 306 nt6.65□□□□□ -1.34
HCM1P25364 DBR1YKL149C 1218 nt6.65□□□□□ -1.34
HCM1P25364 LOT6YLR011W 576 nt6.65□□□□□ -1.34
HCM1P25364 FAR3YMR052W 615 nt6.65□□□□□ -1.34
HCM1P25364 RNH1YMR234W 1047 nt6.65□□□□□ -1.34
HCM1P25364 YNL319WYNL319W 441 nt6.65□□□□□ -1.34
HCM1P25364 MSS51YLR203C 1311 nt6.65□□□□□ -1.35
HCM1P25364 MSC3YLR219W 2187 nt6.65□□□□□ -1.35
HCM1P25364 VTS1YOR359W 1572 nt6.65□□□□□ -1.35
HCM1P25364 PEX22YAL055W 543 nt6.64□□□□□ -1.35
HCM1P25364 CSL4YNL232W 879 nt6.64□□□□□ -1.35
HCM1P25364 YAH1YPL252C 519 nt6.64□□□□□ -1.35
HCM1P25364 FES1YBR101C 873 nt6.64□□□□□ -1.35
HCM1P25364 UIP5YKR044W 1332 nt6.64□□□□□ -1.35
HCM1P25364 IVY1YDR229W 1362 nt6.64□□□□□ -1.35
HCM1P25364 YLL058WYLL058W 1728 nt6.64□□□□□ -1.35
HCM1P25364 EFM1YHL039W 1758 nt6.64□□□□□ -1.35
HCM1P25364 HHY1YEL059W 309 nt6.63□□□□□ -1.35
HCM1P25364 EMP65YER140W 1671 nt6.63□□□□□ -1.35
HCM1P25364 YKR045CYKR045C 552 nt6.63□□□□□ -1.35
HCM1P25364 REX3YLR107W 1215 nt6.63□□□□□ -1.35
HCM1P25364 RSA3YLR221C 663 nt6.63□□□□□ -1.35
HCM1P25364 ELA1YNL230C 1140 nt6.63□□□□□ -1.35
HCM1P25364 YOL107WYOL107W 1029 nt6.63□□□□□ -1.35
HCM1P25364 YOR012WYOR012W 414 nt6.63□□□□□ -1.35
HCM1P25364 YPL277CYPL277C 1464 nt6.63□□□□□ -1.35
HCM1P25364 HSM3YBR272C 1443 nt6.63□□□□□ -1.35
HCM1P25364 MLS1YNL117W 1665 nt6.62□□□□□ -1.35
HCM1P25364 FCY2YER056C 1602 nt6.62□□□□□ -1.35
HCM1P25364 DSF1YEL070W 1509 nt6.62□□□□□ -1.35
HCM1P25364 YNR073CYNR073C 1509 nt6.62□□□□□ -1.35
HCM1P25364 snR82snR82 268 nt6.62□□□□□ -1.35
HCM1P25364 YGL260WYGL260W 231 nt6.62□□□□□ -1.35
HCM1P25364 RPL43AYPR043W 279 nt6.62□□□□□ -1.35
HCM1P25364 ACO1YLR304C 2337 nt6.62□□□□□ -1.35
HCM1P25364 GPA2YER020W 1350 nt6.61□□□□□ -1.35
HCM1P25364 TIM22YDL217C 624 nt6.61□□□□□ -1.35
HCM1P25364 PAC10YGR078C 600 nt6.61□□□□□ -1.35
HCM1P25364 YHR054CYHR054C 1065 nt6.61□□□□□ -1.35
HCM1P25364 PRI1YIR008C 1230 nt6.61□□□□□ -1.35
HCM1P25364 VAM3YOR106W 852 nt6.61□□□□□ -1.35
HCM1P25364 POS5YPL188W 1245 nt6.61□□□□□ -1.35
HCM1P25364 KIN1YDR122W 3195 nt6.61□□□□□ -1.35
HCM1P25364 EHD3YDR036C 1503 nt6.6□□□□□ -1.35
HCM1P25364 DON1YDR273W 1098 nt6.6□□□□□ -1.35
HCM1P25364 YGR011WYGR011W 327 nt6.6□□□□□ -1.35
HCM1P25364 YHR022CYHR022C 771 nt6.6□□□□□ -1.35
HCM1P25364 YOL079WYOL079W 399 nt6.6□□□□□ -1.35
HCM1P25364 RQC1YDR333C 2172 nt6.59□□□□□ -1.35
HCM1P25364 ERG12YMR208W 1332 nt6.59□□□□□ -1.35
HCM1P25364 SNF4YGL115W 969 nt6.59□□□□□ -1.35
HCM1P25364 MAD2YJL030W 591 nt6.59□□□□□ -1.35
HCM1P25364 MEU1YLR017W 1014 nt6.59□□□□□ -1.35
HCM1P25364 YLR169WYLR169W 354 nt6.59□□□□□ -1.35
HCM1P25364 PRM4YPL156C 855 nt6.59□□□□□ -1.35
HCM1P25364 ARR1YPR199C 885 nt6.59□□□□□ -1.35
HCM1P25364 RTC2YBR147W 891 nt6.59□□□□□ -1.35
HCM1P25364 EDC1YGL222C 528 nt6.58□□□□□ -1.36
HCM1P25364 MSA2YKR077W 1092 nt6.58□□□□□ -1.36
HCM1P25364 YNL200CYNL200C 741 nt6.58□□□□□ -1.36
HCM1P25364 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt6.57□□□□□ -1.36
HCM1P25364 YNL303WYNL303W 348 nt6.57□□□□□ -1.36
HCM1P25364 YNR048WYNR048W 1182 nt6.57□□□□□ -1.36
HCM1P25364 DSC2YOL073C 969 nt6.57□□□□□ -1.36
HCM1P25364 TSR3YOR006C 942 nt6.57□□□□□ -1.36
HCM1P25364 SMX3YPR182W 261 nt6.57□□□□□ -1.36
HCM1P25364 AFG3YER017C 2286 nt6.56□□□□□ -1.36
HCM1P25364 MTF2YDL044C 1323 nt6.56□□□□□ -1.36
HCM1P25364 NMD5YJR132W 3147 nt6.56□□□□□ -1.36
HCM1P25364 YGR283CYGR283C 1026 nt6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.3 ms