Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPREP23469 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPREP23469 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPREP23469 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPREP23469 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPREP23469 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPREP23469 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPREP23469 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPREP23469 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPREP23469 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPREP23469 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPREP23469 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPREP23469 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPREP23469 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PTPREP23469 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPREP23469 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPREP23469 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPREP23469 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPREP23469 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPREP23469 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPREP23469 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPREP23469 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPREP23469 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPREP23469 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPREP23469 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPREP23469 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPREP23469 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPREP23469 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPREP23469 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPREP23469 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPREP23469 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPREP23469 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPREP23469 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPREP23469 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPREP23469 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPREP23469 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPREP23469 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPREP23469 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPREP23469 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPREP23469 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPREP23469 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPREP23469 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPREP23469 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPREP23469 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPREP23469 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPREP23469 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPREP23469 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPREP23469 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPREP23469 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPREP23469 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPREP23469 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPREP23469 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPREP23469 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPREP23469 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPREP23469 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPREP23469 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPREP23469 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPREP23469 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPREP23469 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPREP23469 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPREP23469 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPREP23469 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPREP23469 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPREP23469 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPREP23469 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPREP23469 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPREP23469 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPREP23469 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPREP23469 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPREP23469 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPREP23469 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPREP23469 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPREP23469 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPREP23469 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPREP23469 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPREP23469 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPREP23469 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPREP23469 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPREP23469 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPREP23469 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPREP23469 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPREP23469 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPREP23469 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPREP23469 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPREP23469 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPREP23469 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPREP23469 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPREP23469 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPREP23469 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPREP23469 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPREP23469 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPREP23469 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPREP23469 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPREP23469 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPREP23469 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPREP23469 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPREP23469 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPREP23469 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPREP23469 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPREP23469 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms