Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCSHP23434 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCSHP23434 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCSHP23434 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCSHP23434 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GCSHP23434 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCSHP23434 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCSHP23434 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCSHP23434 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCSHP23434 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCSHP23434 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCSHP23434 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCSHP23434 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCSHP23434 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCSHP23434 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCSHP23434 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GCSHP23434 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCSHP23434 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCSHP23434 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCSHP23434 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCSHP23434 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCSHP23434 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCSHP23434 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCSHP23434 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCSHP23434 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCSHP23434 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCSHP23434 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GCSHP23434 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCSHP23434 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GCSHP23434 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCSHP23434 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCSHP23434 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCSHP23434 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCSHP23434 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCSHP23434 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCSHP23434 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCSHP23434 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GCSHP23434 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCSHP23434 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCSHP23434 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCSHP23434 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCSHP23434 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCSHP23434 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCSHP23434 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCSHP23434 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCSHP23434 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCSHP23434 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCSHP23434 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCSHP23434 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCSHP23434 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GCSHP23434 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCSHP23434 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCSHP23434 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCSHP23434 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCSHP23434 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCSHP23434 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCSHP23434 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCSHP23434 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GCSHP23434 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GCSHP23434 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCSHP23434 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GCSHP23434 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCSHP23434 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCSHP23434 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCSHP23434 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCSHP23434 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCSHP23434 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCSHP23434 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCSHP23434 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCSHP23434 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCSHP23434 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCSHP23434 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GCSHP23434 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCSHP23434 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCSHP23434 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCSHP23434 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCSHP23434 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCSHP23434 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GCSHP23434 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCSHP23434 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCSHP23434 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCSHP23434 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GCSHP23434 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCSHP23434 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCSHP23434 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GCSHP23434 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCSHP23434 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCSHP23434 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCSHP23434 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCSHP23434 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GCSHP23434 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCSHP23434 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCSHP23434 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCSHP23434 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GCSHP23434 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCSHP23434 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCSHP23434 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCSHP23434 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCSHP23434 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GCSHP23434 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms