Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB2P22676 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB2P22676 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALB2P22676 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB2P22676 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB2P22676 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB2P22676 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB2P22676 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB2P22676 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALB2P22676 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB2P22676 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB2P22676 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB2P22676 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB2P22676 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB2P22676 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALB2P22676 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALB2P22676 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALB2P22676 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALB2P22676 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALB2P22676 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALB2P22676 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALB2P22676 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB2P22676 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB2P22676 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB2P22676 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB2P22676 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB2P22676 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALB2P22676 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALB2P22676 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALB2P22676 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALB2P22676 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB2P22676 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB2P22676 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB2P22676 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB2P22676 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB2P22676 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB2P22676 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALB2P22676 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB2P22676 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB2P22676 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB2P22676 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB2P22676 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB2P22676 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB2P22676 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALB2P22676 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB2P22676 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB2P22676 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB2P22676 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALB2P22676 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALB2P22676 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALB2P22676 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALB2P22676 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALB2P22676 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALB2P22676 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALB2P22676 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB2P22676 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB2P22676 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB2P22676 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB2P22676 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB2P22676 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB2P22676 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB2P22676 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALB2P22676 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALB2P22676 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALB2P22676 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALB2P22676 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CALB2P22676 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALB2P22676 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALB2P22676 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CALB2P22676 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALB2P22676 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALB2P22676 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CALB2P22676 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALB2P22676 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALB2P22676 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALB2P22676 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALB2P22676 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALB2P22676 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALB2P22676 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALB2P22676 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALB2P22676 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALB2P22676 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALB2P22676 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALB2P22676 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALB2P22676 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALB2P22676 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALB2P22676 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALB2P22676 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALB2P22676 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALB2P22676 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALB2P22676 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALB2P22676 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALB2P22676 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALB2P22676 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALB2P22676 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALB2P22676 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALB2P22676 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALB2P22676 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALB2P22676 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CALB2P22676 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms