Protein–RNA interactions for Protein: P21108

PRPS1L1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1L1P21108 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPS1L1P21108 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPS1L1P21108 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPS1L1P21108 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPS1L1P21108 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms