Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCLP19338 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NCLP19338 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCLP19338 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCLP19338 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NCLP19338 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCLP19338 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCLP19338 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCLP19338 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NCLP19338 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NCLP19338 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCLP19338 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCLP19338 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCLP19338 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NCLP19338 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCLP19338 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCLP19338 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NCLP19338 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCLP19338 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCLP19338 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NCLP19338 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCLP19338 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCLP19338 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCLP19338 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCLP19338 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NCLP19338 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCLP19338 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NCLP19338 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCLP19338 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NCLP19338 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCLP19338 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCLP19338 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NCLP19338 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCLP19338 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NCLP19338 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NCLP19338 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCLP19338 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCLP19338 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCLP19338 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NCLP19338 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NCLP19338 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NCLP19338 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCLP19338 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCLP19338 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCLP19338 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCLP19338 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCLP19338 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCLP19338 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCLP19338 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCLP19338 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NCLP19338 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCLP19338 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCLP19338 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NCLP19338 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCLP19338 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCLP19338 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCLP19338 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCLP19338 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NCLP19338 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCLP19338 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCLP19338 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NCLP19338 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCLP19338 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCLP19338 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCLP19338 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCLP19338 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCLP19338 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NCLP19338 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCLP19338 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NCLP19338 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NCLP19338 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCLP19338 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCLP19338 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NCLP19338 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCLP19338 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCLP19338 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NCLP19338 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NCLP19338 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NCLP19338 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NCLP19338 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCLP19338 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCLP19338 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCLP19338 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCLP19338 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NCLP19338 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NCLP19338 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms