Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NID1P14543 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NID1P14543 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NID1P14543 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NID1P14543 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NID1P14543 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NID1P14543 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NID1P14543 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NID1P14543 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NID1P14543 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NID1P14543 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NID1P14543 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NID1P14543 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NID1P14543 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NID1P14543 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NID1P14543 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NID1P14543 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NID1P14543 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NID1P14543 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NID1P14543 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NID1P14543 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NID1P14543 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NID1P14543 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NID1P14543 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NID1P14543 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NID1P14543 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NID1P14543 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NID1P14543 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NID1P14543 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NID1P14543 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NID1P14543 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NID1P14543 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NID1P14543 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NID1P14543 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NID1P14543 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NID1P14543 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NID1P14543 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NID1P14543 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NID1P14543 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NID1P14543 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NID1P14543 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NID1P14543 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NID1P14543 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NID1P14543 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NID1P14543 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NID1P14543 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NID1P14543 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NID1P14543 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NID1P14543 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NID1P14543 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NID1P14543 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NID1P14543 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NID1P14543 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NID1P14543 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NID1P14543 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NID1P14543 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NID1P14543 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NID1P14543 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NID1P14543 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NID1P14543 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NID1P14543 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NID1P14543 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NID1P14543 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NID1P14543 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NID1P14543 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NID1P14543 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NID1P14543 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NID1P14543 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NID1P14543 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NID1P14543 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NID1P14543 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NID1P14543 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NID1P14543 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NID1P14543 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NID1P14543 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NID1P14543 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NID1P14543 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NID1P14543 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NID1P14543 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NID1P14543 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NID1P14543 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NID1P14543 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NID1P14543 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NID1P14543 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NID1P14543 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NID1P14543 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NID1P14543 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NID1P14543 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NID1P14543 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NID1P14543 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NID1P14543 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NID1P14543 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NID1P14543 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NID1P14543 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NID1P14543 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NID1P14543 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NID1P14543 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NID1P14543 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NID1P14543 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NID1P14543 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms