Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL6A2P12110 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL6A2P12110 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL6A2P12110 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COL6A2P12110 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms