Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM18P0DKX4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM18P0DKX4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM18P0DKX4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms