Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3P09919 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3P09919 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3P09919 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSF3P09919 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3P09919 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3P09919 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3P09919 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3P09919 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3P09919 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3P09919 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3P09919 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3P09919 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3P09919 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CSF3P09919 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3P09919 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3P09919 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3P09919 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSF3P09919 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3P09919 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSF3P09919 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CSF3P09919 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3P09919 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3P09919 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3P09919 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3P09919 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3P09919 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3P09919 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3P09919 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3P09919 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3P09919 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSF3P09919 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF3P09919 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF3P09919 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF3P09919 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF3P09919 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSF3P09919 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSF3P09919 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSF3P09919 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSF3P09919 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CSF3P09919 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSF3P09919 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSF3P09919 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSF3P09919 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSF3P09919 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CSF3P09919 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSF3P09919 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF3P09919 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF3P09919 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF3P09919 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF3P09919 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF3P09919 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF3P09919 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CSF3P09919 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF3P09919 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF3P09919 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF3P09919 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF3P09919 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF3P09919 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSF3P09919 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSF3P09919 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF3P09919 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF3P09919 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF3P09919 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF3P09919 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF3P09919 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSF3P09919 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF3P09919 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF3P09919 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF3P09919 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSF3P09919 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF3P09919 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF3P09919 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF3P09919 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF3P09919 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF3P09919 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF3P09919 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSF3P09919 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF3P09919 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF3P09919 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF3P09919 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF3P09919 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF3P09919 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF3P09919 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSF3P09919 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3P09919 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3P09919 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3P09919 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3P09919 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3P09919 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3P09919 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3P09919 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3P09919 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3P09919 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3P09919 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3P09919 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3P09919 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3P09919 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3P09919 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF3P09919 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms