Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
POLBP06746 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLBP06746 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLBP06746 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLBP06746 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLBP06746 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLBP06746 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLBP06746 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLBP06746 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLBP06746 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLBP06746 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLBP06746 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLBP06746 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLBP06746 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLBP06746 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLBP06746 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLBP06746 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLBP06746 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLBP06746 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLBP06746 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLBP06746 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLBP06746 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLBP06746 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLBP06746 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLBP06746 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLBP06746 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLBP06746 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLBP06746 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLBP06746 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLBP06746 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLBP06746 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLBP06746 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLBP06746 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLBP06746 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLBP06746 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
POLBP06746 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLBP06746 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLBP06746 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLBP06746 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLBP06746 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLBP06746 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLBP06746 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLBP06746 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLBP06746 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLBP06746 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLBP06746 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLBP06746 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLBP06746 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLBP06746 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLBP06746 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLBP06746 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLBP06746 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLBP06746 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLBP06746 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLBP06746 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLBP06746 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLBP06746 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLBP06746 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLBP06746 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLBP06746 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLBP06746 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLBP06746 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLBP06746 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLBP06746 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLBP06746 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLBP06746 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLBP06746 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLBP06746 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLBP06746 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLBP06746 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms