Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKAP2O75563 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SKAP2O75563 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKAP2O75563 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKAP2O75563 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms