Protein–RNA interactions for Protein: O43379

WDR62, WD repeat-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 1,518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR62O43379 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
WDR62O43379 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
WDR62O43379 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
WDR62O43379 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
WDR62O43379 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
WDR62O43379 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
WDR62O43379 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
WDR62O43379 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
WDR62O43379 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
WDR62O43379 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
WDR62O43379 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
WDR62O43379 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
WDR62O43379 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC42.22■■■■■ 4.35
WDR62O43379 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
WDR62O43379 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
WDR62O43379 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
WDR62O43379 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
WDR62O43379 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
WDR62O43379 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
WDR62O43379 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
WDR62O43379 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
WDR62O43379 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
WDR62O43379 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
WDR62O43379 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
WDR62O43379 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
WDR62O43379 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
WDR62O43379 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
WDR62O43379 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
WDR62O43379 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
WDR62O43379 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC42.15■■■■■ 4.34
WDR62O43379 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
WDR62O43379 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
WDR62O43379 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
WDR62O43379 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
WDR62O43379 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
WDR62O43379 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
WDR62O43379 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
WDR62O43379 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
WDR62O43379 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.15■■■■■ 4.34
WDR62O43379 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
WDR62O43379 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
WDR62O43379 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC42.14■■■■■ 4.34
WDR62O43379 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
WDR62O43379 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
WDR62O43379 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
WDR62O43379 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC42.12■■■■■ 4.33
WDR62O43379 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
WDR62O43379 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
WDR62O43379 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
WDR62O43379 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
WDR62O43379 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC42.12■■■■■ 4.33
WDR62O43379 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
WDR62O43379 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
WDR62O43379 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
WDR62O43379 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
WDR62O43379 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
WDR62O43379 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
WDR62O43379 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
WDR62O43379 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
WDR62O43379 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
WDR62O43379 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
WDR62O43379 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
WDR62O43379 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
WDR62O43379 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
WDR62O43379 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
WDR62O43379 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
WDR62O43379 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
WDR62O43379 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
WDR62O43379 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
WDR62O43379 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
WDR62O43379 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
WDR62O43379 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
WDR62O43379 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
WDR62O43379 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
WDR62O43379 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
WDR62O43379 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
WDR62O43379 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
WDR62O43379 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
WDR62O43379 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
WDR62O43379 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
WDR62O43379 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
WDR62O43379 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
WDR62O43379 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
WDR62O43379 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
WDR62O43379 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
WDR62O43379 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
WDR62O43379 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
WDR62O43379 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
WDR62O43379 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
WDR62O43379 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
WDR62O43379 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
WDR62O43379 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
WDR62O43379 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
WDR62O43379 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC42■■■■■ 4.31
WDR62O43379 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
WDR62O43379 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
WDR62O43379 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC42■■■■■ 4.31
WDR62O43379 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
WDR62O43379 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
WDR62O43379 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms