Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRXO43186 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRXO43186 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRXO43186 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRXO43186 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRXO43186 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRXO43186 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRXO43186 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRXO43186 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRXO43186 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRXO43186 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRXO43186 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRXO43186 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRXO43186 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRXO43186 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRXO43186 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRXO43186 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRXO43186 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRXO43186 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRXO43186 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRXO43186 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRXO43186 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRXO43186 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRXO43186 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRXO43186 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRXO43186 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRXO43186 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRXO43186 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRXO43186 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRXO43186 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CRXO43186 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CRXO43186 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRXO43186 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRXO43186 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRXO43186 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRXO43186 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRXO43186 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CRXO43186 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRXO43186 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRXO43186 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRXO43186 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRXO43186 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRXO43186 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRXO43186 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CRXO43186 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRXO43186 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRXO43186 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRXO43186 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRXO43186 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRXO43186 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRXO43186 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CRXO43186 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRXO43186 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CRXO43186 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRXO43186 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRXO43186 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRXO43186 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRXO43186 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRXO43186 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRXO43186 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRXO43186 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRXO43186 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRXO43186 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRXO43186 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRXO43186 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRXO43186 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRXO43186 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CRXO43186 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRXO43186 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRXO43186 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRXO43186 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRXO43186 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRXO43186 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRXO43186 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRXO43186 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CRXO43186 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRXO43186 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CRXO43186 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRXO43186 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRXO43186 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRXO43186 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRXO43186 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CRXO43186 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRXO43186 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRXO43186 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRXO43186 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRXO43186 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRXO43186 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CRXO43186 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRXO43186 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRXO43186 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRXO43186 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRXO43186 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRXO43186 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CRXO43186 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRXO43186 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRXO43186 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRXO43186 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRXO43186 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CRXO43186 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms