Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHGDHO43175 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PHGDHO43175 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHGDHO43175 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms