Protein–RNA interactions for Protein: O15530

PDPK1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPK1O15530 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPK1O15530 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPK1O15530 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPK1O15530 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDPK1O15530 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDPK1O15530 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDPK1O15530 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDPK1O15530 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDPK1O15530 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDPK1O15530 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms