Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRD28O15084 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRD28O15084 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ANKRD28O15084 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms