Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BHLHE40O14503 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BHLHE40O14503 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BHLHE40O14503 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms