Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC85CA6NKD9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC85CA6NKD9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC85CA6NKD9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC85CA6NKD9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC85CA6NKD9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC85CA6NKD9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC85CA6NKD9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC85CA6NKD9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC85CA6NKD9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC85CA6NKD9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms