Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ZNF316A6NFI3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ZNF316A6NFI3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ZNF316A6NFI3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF316A6NFI3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF316A6NFI3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms