Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC182A6NF36 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC182A6NF36 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC182A6NF36 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms