Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS37CA5D8V6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS37CA5D8V6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VPS37CA5D8V6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VPS37CA5D8V6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms