Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A087X0B3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A087X0B3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
A0A087X0B3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms