Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV27A0A087WT01 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV27A0A087WT01 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAV27A0A087WT01 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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