Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PHLDA3Q9Y5J5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms