Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms