Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RCE1Q9Y256 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms