Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVW-1Q9UQF0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVW-1Q9UQF0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms